去日本大学毕业难吗？
这个就要看题主选择的学校和专业了，一般来说日本的大学都是宽进严出，只要进了大门基本都能拿到毕业证（当然，你什么都没学肯定不行）但是如果想拿优秀的成绩那可就要下苦功夫了。 这里我大概讲一下一般情况，以东京大学为例，它的绝大部分本科教学都是使用日语进行的，对于留学生来说需要学习日语同时加上本校组织的英文考试以及留考才能申请到东大，那么语言关就是必须要过的，不过据说东大的外国人入学试验的通过率还是比较高的，大部分学生过语言关也不是难事，这样就已经成功了一半；
另外一半就是你的课业成绩，日本是学分制，修满要求的分数就能毕业（当然你选的学校和专业不同要求也会有所不同）。一般来说日本大学的课业压力都比较大，教授会给同学布置大量的阅读材料和学习任务，然后定期会有小测验和大测验来检测你的学习成果，如果你无法完成这些测试你就不能得到相应的学分，如果没有足够的学分你就要参加补考甚至重修，这样就可以想象一下你的学业压力有多大。不过如果你选择了比较水的专业的话就另当别论了。
至于你说想申请好的学校有没有可能，有肯定是有的，只要你语言过关并且能拿到优秀的GPA加一定的科研经历和托福雅思成绩（理科生不需要这部分成绩）那就问题不大，像早稻田、庆应这类学校也是有机会申请的。
以上是我的个人意见仅供参考。