麦吉尔的医学项目是它的看家招牌。位于皇家山附近的麦吉尔健康科学中心（McGill University Health Centre， MUHC）是加拿大最大，最先进的医院中心之一。而其附属医院皇家维多利亚医院（Royal Victoria Hospital）的蒙特利尔神经学研究所和医院（Montreal Neurological Institute and Hospital），则汇集了全世界神经科学领域最顶尖的医学家和科学家，神经外科在世界知名，20世纪后期和21世纪初期著名的大脑神经科学家让-多梅勒·斯特劳塔塔（Jean-Dominique，Stratmann），也是在此长期工作后，才在2015年转投美国医学界。
麦吉尔大学护理学院同样在加拿大名列前茅，和美国匹兹堡大学护理学院有双学位交换合作。
工程：
麦吉尔的工程学院规模较大，包括8个系，960名本科生和540名研究生。加拿大知名汽车媒体测试中心（Canadian Automobile Association， CAA），以及著名的加拿大航天研究中心（Space Centre），是工程学院主要的科研基地。计算机科学实验室则由加拿大软件研究中心（Software Engineering Institute），加拿大先进微电子集成电路试验室（Microelectronics Research Centre），加拿大语音识别技术研究中心（Speech Technologies and Research laboratory），加拿大计算语言学中心（Computational Linguistics Laboratory）共同构成。计算机硬件与软件实力和美国宾夕法尼亚大学相比也不逊色。
理科：
麦吉尔的理科实力在加拿大首屈一指。地理系和美国康奈尔大学地理系合作，拥有全球最强的地理信息系统（GIS）专业。数学系的数学研究中心（Centre of mathematics Research）是全加拿大水平最高的数学研究机构。其量子物理，在加拿大排名第一，是理论物理学和天体物理学的重镇，21世纪世界著名华人理论物理学家李政道就是在此任教。化学系和工程学院合作，是加拿大化工领域第一实力派专家，有加拿大化工研究中心（Chemical Engineering institute of Montreal）。
